Kostol je centrom samostatnej farnosti v južnej časti mesta, vysvätený bol roku 1997. Tri zvony vo veži kostola sú zasvätené sv. Františkovi, Panne Márii a sv. košickým mučeníkom. Posvätil ich pápež Ján Pavol II. v Košiciach - Barci v nedeľu 2. júla 1995 po kanonizácii košických mučeníkov.
V interiéri kostola je umiestnená socha sv. Františka a vzácne barokové súsošie sv. Jána Nepomuckého a Panny Márie s Ježiškom.
Barokové súsošie sv. Jána Nepomuckého a Panny Márie s Ježiškom - súsošie sa nachádza v rímskokatolíckom kostole sv. Františka z Assisi. Predstavuje typickú barokovú exteriérovú plastiku vysokej umeleckej hodnoty. Pochádza z r. 1770 a časovo i slohovo korešponduje s barokovými úpravami kláštora pavlínov. Skupina plastík je z pieskovca. Kľačiaci svätec v bohato nariasenom rúchu v ľavej ruke drží palmový list, v pravej pokrývku hlavy. Panna Mária polosediaca v rúchu s bohatou drapériou drží pri kolenách stojaceho Ježiška. Postavy sa vznášajú na iluzívnych rotujúcich oblakoch. Plastika bola zaradená do štátneho zoznamu kultúrnych pamiatok v roku 1986.